Dokumentace lze podepsat i hromadně, z menu Pacienti > Hromadný export do eParafa.
Při spuštění funkce se zobrazí filtrační formulář, kde můžete omezit rozsah podepisovaných dokumentů. Filtrovat lze podle data (od, do), vybraného lékaře, pracoviště, popřípadě dle konkrétního pacienta. Pokud je volba [x] Ignorovat podepsané návštěvy aktivní, již podepsané návštěvy se znovu nepodepisují. Dále lze nastavit volba [x] Ignorovat návštěvy s nevyžadovanou účastí pacienta, díky které se nebudou podepisovat návštěvy, kterým byl nastaven příznak s účastí pacienta nevyžadován.
Pokud např. lékař pracuje na více pracovištích a chcete podepsat všechny jeho záznamy, u pole Pracoviště odstraňte ikonou 
automaticky předvyplněné pracoviště.
Po potvrzení filtračního formuláře (tlačítko [OK] nebo klávesa >>Enter) se zobrazí první dekurs v náhledu k podepsání.
Ve spodní části formuláře je umístěno tlačítko [Konfigurace], kde můžete vybrat certifikát, kterým budou dokumenty podepsány, a další nastavení modulu eParafa.
Podepisovat jednotlivé dokumenty lze tlačítkem [Pokračovat >]. Pokud nechcete daný záznam podepsat, klikněte na tlačítko [Přeskočit]. Jestliže chcete, aby program návštěvy podepisoval automaticky, aktivujte volbu [x] Pokračovat automaticky >> a zadejte do pole Doba náhledu počet sekund, jak dlouho má být zobrazen záznam před podepsáním. Doba lze nastavit 0-9 sekund.
Volbou [x] Po poslední návštěvě zavřít můžete nastavit, aby se průvodce po poslední návštěvě automaticky zavřel. Pokud dojde k jakékoliv chybě, tato volba se ignoruje - aby uživatel viděl, že došlo k nějakému problému. Tato volba se hodí například při ukončování programu. Změníte-li tuto hodnotu v nastavení, zapamatuje se. Pokud jí aktivujete pouze na formuláři, nastavení se aplikuje pouze pro aktuální export.
Po celou dobu podepisování je vidět, kolik záznamů je celkově připraveno k podpisu a kolik již bylo podepsáno. Tento údaj je zobrazen jak číselně, tak i na indikátoru průběhu v grafické podobě.
Pokud se rozhodnete proces podepisování ukončit, můžete tak učinit zavřením formuláře. Již podepsané dokumenty budou uloženy, zbytek nepodepsaných dokumentů se nepodepíše.
Po podpisu všech dekursů se v pravém dolním rohu zobrazí tlačítko [Zavřít], které ukončí hromadný export.